Construcción gótica que fue dañada por efectos de una explosión que destruyo la fortaleza militar asentada en el cerro en cuyas faldas se encuentra situada. Fue construida entre los siglos XIII y XIV. Tiene una fachada con un artÃstico rosetón y un claustro gótico.
Es de tres naves y tres ábsides, coro a los pies con antepecho calado de Simón de Colonia (siglo

XVI). La fachada y el claustro anexo son de estilo gótico.
Tiene pilares cilÃndricos con baquetones y bóvedas de crucerÃa sencillas.
Varios sepulcros de interés de finales del gótico, obra de Nicolás de Vergara, Simón de Colonia y Juan de Vallejo. Púlpito renacentista y portada renacentista que da paso al claustro gótico.
La portada de la iglesia es abocinada, de arco apuntado, y cuenta con imágenes en las jambas, arquivoltas y tÃmpano. Sobre ella hay un gran rosetón calado.
La Iglesia de San Esteban, sin culto en la actualidad, posee una rica colección de tapices y dos tablas de la escuela castellana de pintura. En ella se presenta el
Museo del Retablo, con retablos de pequeñas iglesias burgalesas.
Si se quiere visitar, consultar los
horarios del citado museo.